Tidak seperti kebanyakan kedai ramen Hakodate, yang mengkhusus kepada air rebusan shio (garam) ringan, sup miso Takahashiya kaya dan berminyak. Terdapat dua jenis: khinzir dan ayam. Miso sebenar dibuat dengan tangan oleh chef dan, satu lagi cara ia tidak mengikut tradisi ialah rasanya yang pedas.