Situs Peninggalan Kakinoshima berlokasi di sebelah Museum “Pusat Budaya Jomon Hakodate” yang memamerkan harta nasional. Di sini ditemukan peninggalan pemukiman dalam rentang waktu yang panjang yaitu sekitar 9.000-3.000 tahun yang lalu. Situs peninggalan ini sangatlah penting. Situs peninggalan ini tercatat sebagai Warisan Budaya Dunia UNESCO pada bulan Juli tahun 2021.

Ciri paling khas dari situs ini adalah fitur dari gundukan tanah yang berbentuk huruf U. Fitur ini adalah yang terbesar di Jepang dengan panjang 190 m dan lebar 120 m. Di dalam gundukan tanah ditemukan tembikar, perkakas dari batu dan juga lubang yang diduga kuburan. Di bagian dalam dan tengah dari fitur terdapat seperti gundukan pada lapangan baseball yang sedikit lebih tinggi dan diduga merupakan tempat khusus untuk berdoa.