Hotel dan penginapan bergaya Jepang dengan kisaran pertengahan hingga mewah menawarkan pengalaman bersantap sempurna, menyajikan berbagai bahan yang tumbuh setempat di wilayah Hakodate. Kebanyakan wisatawan Jepang pada umumnya menikmati berendam di dalam sumber mata air panas terlebih dahulu lalu masuk ke yukata yang disediakan di kamar mereka sebelum menyantap makan malam. Dengan cara ini, bir terasa lebih nikmat dan percakapan mengalir lebih mudah! Cobalah!

Banyak hotel dan penginapan bergaya Jepang di Hakodate dilengkapi dengan kolam sumber mata air panas berukuran besar. Beberapa di antaranya menawarkan pemandangan luar biasa memesona ke laut atau taman Jepang dari kemewahan kolam. Sumber mata air panas meremajakan tubuh Anda dan dikenal berfaedah pula untuk melawan kelelahan, nyeri urat saraf, nyeri punggung bawah, penyakit pencernaan, penyakit sistem reproduksi wanita dan penyakit sedang lain.

Di Hakodate terdapat Hotel & Resor Spa "La Vista Hakodate Bay," yang dipilih oleh TripAdvisor sebagai "hotel dengan sarapan lezat" Jepang terbaik di tahun 2012. Banyak hotel menawarkan sarapan bergaya prasmanan yang membiarkan para tamu memilih apa yang mereka ingin santap dari beraneka ragam sajian Jepang dan barat, yang dibuat dengan bahan-bahan paling segar Hakodate. Sarapan ala Jepang adalah santapan standar di penginapan bergaya Jepang.