大船遗迹与垣之岛遗迹距离约10分钟车程。在这里发现了数量庞大的居住遗迹，时间大约是5500至4000年前左右。本遗迹于2021年7月成功登录联合国教科文组织世界文化遗产。

大船遗迹的特征是巨大居住遗迹。大型遗迹甚至直径超过10米，深度2米以上。除此之外，还发现不同时代的居住遗迹层层相叠，由此可以推断曾经长时间在此居住。